Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHB16Q9NRJ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDHB16Q9NRJ7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDHB16Q9NRJ7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms