Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ1

MKKS, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKKSQ9NPJ1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKKSQ9NPJ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKKSQ9NPJ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKKSQ9NPJ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms