Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A4GALTQ9NPC4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A4GALTQ9NPC4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
A4GALTQ9NPC4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
A4GALTQ9NPC4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A4GALTQ9NPC4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A4GALTQ9NPC4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A4GALTQ9NPC4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A4GALTQ9NPC4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A4GALTQ9NPC4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A4GALTQ9NPC4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A4GALTQ9NPC4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A4GALTQ9NPC4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A4GALTQ9NPC4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A4GALTQ9NPC4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
A4GALTQ9NPC4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A4GALTQ9NPC4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A4GALTQ9NPC4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms