Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBV1

POPDC3, Popeye domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC3Q9HBV1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POPDC3Q9HBV1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POPDC3Q9HBV1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POPDC3Q9HBV1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POPDC3Q9HBV1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POPDC3Q9HBV1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POPDC3Q9HBV1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POPDC3Q9HBV1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POPDC3Q9HBV1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POPDC3Q9HBV1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POPDC3Q9HBV1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POPDC3Q9HBV1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POPDC3Q9HBV1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POPDC3Q9HBV1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POPDC3Q9HBV1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POPDC3Q9HBV1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POPDC3Q9HBV1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POPDC3Q9HBV1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms