Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EHD4Q9H223 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EHD4Q9H223 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EHD4Q9H223 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EHD4Q9H223 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EHD4Q9H223 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
EHD4Q9H223 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EHD4Q9H223 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EHD4Q9H223 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EHD4Q9H223 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EHD4Q9H223 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EHD4Q9H223 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EHD4Q9H223 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EHD4Q9H223 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EHD4Q9H223 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EHD4Q9H223 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EHD4Q9H223 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EHD4Q9H223 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EHD4Q9H223 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EHD4Q9H223 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EHD4Q9H223 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EHD4Q9H223 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EHD4Q9H223 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EHD4Q9H223 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EHD4Q9H223 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
EHD4Q9H223 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms