Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RSPH6AQ9H0K4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RSPH6AQ9H0K4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RSPH6AQ9H0K4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RSPH6AQ9H0K4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RSPH6AQ9H0K4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RSPH6AQ9H0K4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RSPH6AQ9H0K4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RSPH6AQ9H0K4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
RSPH6AQ9H0K4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RSPH6AQ9H0K4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RSPH6AQ9H0K4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSPH6AQ9H0K4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSPH6AQ9H0K4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSPH6AQ9H0K4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
RSPH6AQ9H0K4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSPH6AQ9H0K4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSPH6AQ9H0K4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSPH6AQ9H0K4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSPH6AQ9H0K4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSPH6AQ9H0K4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSPH6AQ9H0K4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RSPH6AQ9H0K4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RSPH6AQ9H0K4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RSPH6AQ9H0K4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RSPH6AQ9H0K4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSPH6AQ9H0K4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSPH6AQ9H0K4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSPH6AQ9H0K4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
RSPH6AQ9H0K4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSPH6AQ9H0K4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSPH6AQ9H0K4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSPH6AQ9H0K4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSPH6AQ9H0K4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSPH6AQ9H0K4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSPH6AQ9H0K4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSPH6AQ9H0K4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RSPH6AQ9H0K4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RSPH6AQ9H0K4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RSPH6AQ9H0K4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH6AQ9H0K4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH6AQ9H0K4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RSPH6AQ9H0K4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RSPH6AQ9H0K4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RSPH6AQ9H0K4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RSPH6AQ9H0K4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RSPH6AQ9H0K4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RSPH6AQ9H0K4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RSPH6AQ9H0K4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RSPH6AQ9H0K4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RSPH6AQ9H0K4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RSPH6AQ9H0K4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RSPH6AQ9H0K4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RSPH6AQ9H0K4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSPH6AQ9H0K4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSPH6AQ9H0K4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSPH6AQ9H0K4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSPH6AQ9H0K4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSPH6AQ9H0K4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSPH6AQ9H0K4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSPH6AQ9H0K4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 950.6 ms