Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM6Q9C030 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM6Q9C030 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM6Q9C030 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM6Q9C030 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM6Q9C030 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM6Q9C030 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM6Q9C030 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM6Q9C030 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM6Q9C030 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM6Q9C030 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM6Q9C030 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM6Q9C030 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM6Q9C030 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM6Q9C030 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM6Q9C030 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM6Q9C030 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM6Q9C030 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM6Q9C030 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM6Q9C030 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM6Q9C030 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM6Q9C030 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM6Q9C030 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM6Q9C030 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM6Q9C030 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM6Q9C030 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM6Q9C030 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM6Q9C030 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM6Q9C030 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM6Q9C030 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM6Q9C030 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM6Q9C030 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM6Q9C030 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM6Q9C030 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM6Q9C030 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM6Q9C030 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM6Q9C030 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM6Q9C030 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM6Q9C030 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM6Q9C030 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM6Q9C030 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM6Q9C030 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM6Q9C030 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM6Q9C030 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM6Q9C030 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM6Q9C030 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM6Q9C030 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM6Q9C030 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM6Q9C030 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM6Q9C030 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM6Q9C030 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms