Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TM6SF2Q9BZW4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM6SF2Q9BZW4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM6SF2Q9BZW4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms