Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF4Q9BSR8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
YIPF4Q9BSR8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
YIPF4Q9BSR8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
YIPF4Q9BSR8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YIPF4Q9BSR8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
YIPF4Q9BSR8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
YIPF4Q9BSR8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YIPF4Q9BSR8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms