Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
VGLL1Q99990 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VGLL1Q99990 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL1Q99990 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL1Q99990 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL1Q99990 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL1Q99990 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL1Q99990 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL1Q99990 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VGLL1Q99990 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL1Q99990 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL1Q99990 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL1Q99990 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL1Q99990 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VGLL1Q99990 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL1Q99990 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL1Q99990 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VGLL1Q99990 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms