Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSG101Q99816 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSG101Q99816 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSG101Q99816 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TSG101Q99816 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TSG101Q99816 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSG101Q99816 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSG101Q99816 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSG101Q99816 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSG101Q99816 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms