Protein–RNA interactions for Protein: Q99470

SDF2, Stromal cell-derived factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF2Q99470 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF2Q99470 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF2Q99470 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF2Q99470 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF2Q99470 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SDF2Q99470 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDF2Q99470 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDF2Q99470 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms