Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD2Q96M20 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD2Q96M20 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD2Q96M20 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD2Q96M20 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD2Q96M20 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD2Q96M20 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD2Q96M20 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD2Q96M20 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD2Q96M20 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD2Q96M20 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD2Q96M20 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNBD2Q96M20 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNBD2Q96M20 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNBD2Q96M20 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNBD2Q96M20 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNBD2Q96M20 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD2Q96M20 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms