Protein–RNA interactions for Protein: Q96L50

LRR1, Leucine-rich repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRR1Q96L50 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRR1Q96L50 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRR1Q96L50 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRR1Q96L50 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRR1Q96L50 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms