Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLPTM1LQ96KA5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLPTM1LQ96KA5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLPTM1LQ96KA5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms