Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC41A2Q96JW4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC41A2Q96JW4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC41A2Q96JW4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC41A2Q96JW4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms