Protein–RNA interactions for Protein: Q96CD2

PPCDC, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCDCQ96CD2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPCDCQ96CD2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PPCDCQ96CD2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPCDCQ96CD2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPCDCQ96CD2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPCDCQ96CD2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPCDCQ96CD2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPCDCQ96CD2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPCDCQ96CD2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPCDCQ96CD2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PPCDCQ96CD2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPCDCQ96CD2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPCDCQ96CD2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPCDCQ96CD2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPCDCQ96CD2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPCDCQ96CD2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPCDCQ96CD2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PPCDCQ96CD2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPCDCQ96CD2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPCDCQ96CD2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPCDCQ96CD2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPCDCQ96CD2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPCDCQ96CD2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPCDCQ96CD2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPCDCQ96CD2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPCDCQ96CD2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPCDCQ96CD2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPCDCQ96CD2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPCDCQ96CD2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms