Protein–RNA interactions for Protein: Q969M7

UBE2F, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2FQ969M7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2FQ969M7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2FQ969M7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2FQ969M7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2FQ969M7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2FQ969M7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2FQ969M7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2FQ969M7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2FQ969M7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2FQ969M7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2FQ969M7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2FQ969M7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2FQ969M7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2FQ969M7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2FQ969M7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2FQ969M7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2FQ969M7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2FQ969M7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2FQ969M7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2FQ969M7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2FQ969M7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE2FQ969M7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2FQ969M7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms