Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CASKIN2Q8WXE0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASKIN2Q8WXE0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASKIN2Q8WXE0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASKIN2Q8WXE0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASKIN2Q8WXE0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASKIN2Q8WXE0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASKIN2Q8WXE0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASKIN2Q8WXE0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASKIN2Q8WXE0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASKIN2Q8WXE0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASKIN2Q8WXE0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASKIN2Q8WXE0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASKIN2Q8WXE0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASKIN2Q8WXE0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASKIN2Q8WXE0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASKIN2Q8WXE0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASKIN2Q8WXE0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASKIN2Q8WXE0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASKIN2Q8WXE0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CASKIN2Q8WXE0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASKIN2Q8WXE0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASKIN2Q8WXE0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASKIN2Q8WXE0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASKIN2Q8WXE0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASKIN2Q8WXE0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASKIN2Q8WXE0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASKIN2Q8WXE0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASKIN2Q8WXE0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CASKIN2Q8WXE0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASKIN2Q8WXE0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASKIN2Q8WXE0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASKIN2Q8WXE0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASKIN2Q8WXE0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms