Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ5

TNIP2, TNFAIP3-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2Q8NFZ5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNIP2Q8NFZ5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNIP2Q8NFZ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP2Q8NFZ5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNIP2Q8NFZ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms