Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CARMIL3Q8ND23 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CARMIL3Q8ND23 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CARMIL3Q8ND23 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CARMIL3Q8ND23 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL3Q8ND23 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL3Q8ND23 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL3Q8ND23 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL3Q8ND23 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL3Q8ND23 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL3Q8ND23 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL3Q8ND23 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL3Q8ND23 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL3Q8ND23 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL3Q8ND23 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL3Q8ND23 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL3Q8ND23 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL3Q8ND23 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CARMIL3Q8ND23 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL3Q8ND23 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL3Q8ND23 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL3Q8ND23 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL3Q8ND23 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL3Q8ND23 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL3Q8ND23 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL3Q8ND23 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL3Q8ND23 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL3Q8ND23 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARMIL3Q8ND23 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL3Q8ND23 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL3Q8ND23 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARMIL3Q8ND23 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARMIL3Q8ND23 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARMIL3Q8ND23 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL3Q8ND23 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL3Q8ND23 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL3Q8ND23 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL3Q8ND23 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL3Q8ND23 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL3Q8ND23 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CARMIL3Q8ND23 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
CARMIL3Q8ND23 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms