Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDKL3Q8IVW4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDKL3Q8IVW4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDKL3Q8IVW4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDKL3Q8IVW4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDKL3Q8IVW4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDKL3Q8IVW4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CDKL3Q8IVW4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDKL3Q8IVW4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDKL3Q8IVW4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDKL3Q8IVW4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDKL3Q8IVW4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDKL3Q8IVW4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDKL3Q8IVW4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDKL3Q8IVW4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKL3Q8IVW4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKL3Q8IVW4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKL3Q8IVW4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDKL3Q8IVW4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDKL3Q8IVW4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDKL3Q8IVW4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDKL3Q8IVW4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDKL3Q8IVW4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDKL3Q8IVW4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKL3Q8IVW4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKL3Q8IVW4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKL3Q8IVW4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKL3Q8IVW4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms