Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVV8

NKAIN4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKAIN4Q8IVV8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NKAIN4Q8IVV8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKAIN4Q8IVV8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKAIN4Q8IVV8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKAIN4Q8IVV8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms