Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FMNL3Q8IVF7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FMNL3Q8IVF7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FMNL3Q8IVF7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FMNL3Q8IVF7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FMNL3Q8IVF7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FMNL3Q8IVF7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FMNL3Q8IVF7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms