Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FMNL3Q8IVF7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
FMNL3Q8IVF7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
FMNL3Q8IVF7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
FMNL3Q8IVF7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
FMNL3Q8IVF7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
FMNL3Q8IVF7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FMNL3Q8IVF7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
FMNL3Q8IVF7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
FMNL3Q8IVF7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FMNL3Q8IVF7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
FMNL3Q8IVF7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FMNL3Q8IVF7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
FMNL3Q8IVF7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FMNL3Q8IVF7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FMNL3Q8IVF7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
FMNL3Q8IVF7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
FMNL3Q8IVF7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
FMNL3Q8IVF7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
FMNL3Q8IVF7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
FMNL3Q8IVF7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FMNL3Q8IVF7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FMNL3Q8IVF7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
FMNL3Q8IVF7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FMNL3Q8IVF7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FMNL3Q8IVF7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FMNL3Q8IVF7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FMNL3Q8IVF7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FMNL3Q8IVF7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FMNL3Q8IVF7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FMNL3Q8IVF7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FMNL3Q8IVF7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
FMNL3Q8IVF7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FMNL3Q8IVF7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FMNL3Q8IVF7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FMNL3Q8IVF7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FMNL3Q8IVF7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
FMNL3Q8IVF7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
FMNL3Q8IVF7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
FMNL3Q8IVF7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FMNL3Q8IVF7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FMNL3Q8IVF7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FMNL3Q8IVF7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
FMNL3Q8IVF7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
FMNL3Q8IVF7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FMNL3Q8IVF7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FMNL3Q8IVF7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FMNL3Q8IVF7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FMNL3Q8IVF7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FMNL3Q8IVF7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FMNL3Q8IVF7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FMNL3Q8IVF7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FMNL3Q8IVF7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FMNL3Q8IVF7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FMNL3Q8IVF7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FMNL3Q8IVF7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FMNL3Q8IVF7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FMNL3Q8IVF7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FMNL3Q8IVF7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FMNL3Q8IVF7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FMNL3Q8IVF7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FMNL3Q8IVF7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FMNL3Q8IVF7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FMNL3Q8IVF7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
FMNL3Q8IVF7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
FMNL3Q8IVF7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
FMNL3Q8IVF7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FMNL3Q8IVF7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
FMNL3Q8IVF7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FMNL3Q8IVF7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FMNL3Q8IVF7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FMNL3Q8IVF7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FMNL3Q8IVF7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
FMNL3Q8IVF7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
FMNL3Q8IVF7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FMNL3Q8IVF7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
FMNL3Q8IVF7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FMNL3Q8IVF7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FMNL3Q8IVF7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FMNL3Q8IVF7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FMNL3Q8IVF7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FMNL3Q8IVF7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
FMNL3Q8IVF7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
FMNL3Q8IVF7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FMNL3Q8IVF7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FMNL3Q8IVF7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FMNL3Q8IVF7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FMNL3Q8IVF7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FMNL3Q8IVF7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
FMNL3Q8IVF7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
FMNL3Q8IVF7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
FMNL3Q8IVF7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
FMNL3Q8IVF7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
FMNL3Q8IVF7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
FMNL3Q8IVF7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FMNL3Q8IVF7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FMNL3Q8IVF7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FMNL3Q8IVF7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FMNL3Q8IVF7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
FMNL3Q8IVF7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms