Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BNC2Q6ZN30 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BNC2Q6ZN30 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BNC2Q6ZN30 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BNC2Q6ZN30 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BNC2Q6ZN30 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BNC2Q6ZN30 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BNC2Q6ZN30 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BNC2Q6ZN30 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNC2Q6ZN30 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNC2Q6ZN30 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNC2Q6ZN30 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms