Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BNC2Q6ZN30 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
BNC2Q6ZN30 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
BNC2Q6ZN30 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
BNC2Q6ZN30 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
BNC2Q6ZN30 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
BNC2Q6ZN30 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
BNC2Q6ZN30 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
BNC2Q6ZN30 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BNC2Q6ZN30 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
BNC2Q6ZN30 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
BNC2Q6ZN30 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BNC2Q6ZN30 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BNC2Q6ZN30 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
BNC2Q6ZN30 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BNC2Q6ZN30 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BNC2Q6ZN30 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
BNC2Q6ZN30 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BNC2Q6ZN30 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BNC2Q6ZN30 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BNC2Q6ZN30 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BNC2Q6ZN30 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
BNC2Q6ZN30 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BNC2Q6ZN30 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BNC2Q6ZN30 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BNC2Q6ZN30 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BNC2Q6ZN30 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BNC2Q6ZN30 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BNC2Q6ZN30 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BNC2Q6ZN30 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BNC2Q6ZN30 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BNC2Q6ZN30 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BNC2Q6ZN30 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BNC2Q6ZN30 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BNC2Q6ZN30 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BNC2Q6ZN30 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BNC2Q6ZN30 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BNC2Q6ZN30 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BNC2Q6ZN30 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BNC2Q6ZN30 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BNC2Q6ZN30 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BNC2Q6ZN30 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BNC2Q6ZN30 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BNC2Q6ZN30 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BNC2Q6ZN30 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BNC2Q6ZN30 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BNC2Q6ZN30 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BNC2Q6ZN30 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BNC2Q6ZN30 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
BNC2Q6ZN30 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BNC2Q6ZN30 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BNC2Q6ZN30 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BNC2Q6ZN30 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BNC2Q6ZN30 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BNC2Q6ZN30 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BNC2Q6ZN30 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BNC2Q6ZN30 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BNC2Q6ZN30 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BNC2Q6ZN30 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BNC2Q6ZN30 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BNC2Q6ZN30 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BNC2Q6ZN30 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BNC2Q6ZN30 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BNC2Q6ZN30 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BNC2Q6ZN30 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BNC2Q6ZN30 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BNC2Q6ZN30 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BNC2Q6ZN30 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BNC2Q6ZN30 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BNC2Q6ZN30 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BNC2Q6ZN30 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BNC2Q6ZN30 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BNC2Q6ZN30 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BNC2Q6ZN30 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BNC2Q6ZN30 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BNC2Q6ZN30 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BNC2Q6ZN30 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BNC2Q6ZN30 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BNC2Q6ZN30 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BNC2Q6ZN30 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BNC2Q6ZN30 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BNC2Q6ZN30 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BNC2Q6ZN30 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BNC2Q6ZN30 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BNC2Q6ZN30 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BNC2Q6ZN30 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BNC2Q6ZN30 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
BNC2Q6ZN30 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BNC2Q6ZN30 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BNC2Q6ZN30 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BNC2Q6ZN30 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BNC2Q6ZN30 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BNC2Q6ZN30 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BNC2Q6ZN30 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BNC2Q6ZN30 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BNC2Q6ZN30 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BNC2Q6ZN30 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BNC2Q6ZN30 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BNC2Q6ZN30 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BNC2Q6ZN30 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms