Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OPN5Q6U736 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
OPN5Q6U736 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OPN5Q6U736 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN5Q6U736 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms