Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SARM1Q6SZW1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SARM1Q6SZW1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SARM1Q6SZW1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SARM1Q6SZW1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SARM1Q6SZW1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SARM1Q6SZW1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SARM1Q6SZW1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SARM1Q6SZW1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SARM1Q6SZW1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SARM1Q6SZW1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SARM1Q6SZW1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SARM1Q6SZW1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SARM1Q6SZW1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SARM1Q6SZW1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SARM1Q6SZW1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SARM1Q6SZW1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SARM1Q6SZW1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SARM1Q6SZW1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SARM1Q6SZW1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SARM1Q6SZW1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SARM1Q6SZW1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SARM1Q6SZW1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SARM1Q6SZW1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SARM1Q6SZW1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SARM1Q6SZW1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms