Protein–RNA interactions for Protein: Q6P499

NIPAL3, NIPA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL3Q6P499 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIPAL3Q6P499 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPAL3Q6P499 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL3Q6P499 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms