Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPECC1LQ69YQ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPECC1LQ69YQ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPECC1LQ69YQ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPECC1LQ69YQ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SPECC1LQ69YQ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPECC1LQ69YQ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SPECC1LQ69YQ0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPECC1LQ69YQ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SPECC1LQ69YQ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPECC1LQ69YQ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPECC1LQ69YQ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPECC1LQ69YQ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPECC1LQ69YQ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPECC1LQ69YQ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPECC1LQ69YQ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPECC1LQ69YQ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPECC1LQ69YQ0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPECC1LQ69YQ0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPECC1LQ69YQ0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPECC1LQ69YQ0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPECC1LQ69YQ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPECC1LQ69YQ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPECC1LQ69YQ0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPECC1LQ69YQ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPECC1LQ69YQ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPECC1LQ69YQ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPECC1LQ69YQ0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPECC1LQ69YQ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPECC1LQ69YQ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPECC1LQ69YQ0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPECC1LQ69YQ0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPECC1LQ69YQ0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPECC1LQ69YQ0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPECC1LQ69YQ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPECC1LQ69YQ0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPECC1LQ69YQ0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPECC1LQ69YQ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPECC1LQ69YQ0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms