Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
SPECC1LQ69YQ0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SPECC1LQ69YQ0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SPECC1LQ69YQ0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SPECC1LQ69YQ0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SPECC1LQ69YQ0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.88■■■■□ 3.34
SPECC1LQ69YQ0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SPECC1LQ69YQ0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SPECC1LQ69YQ0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SPECC1LQ69YQ0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SPECC1LQ69YQ0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SPECC1LQ69YQ0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SPECC1LQ69YQ0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SPECC1LQ69YQ0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SPECC1LQ69YQ0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SPECC1LQ69YQ0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SPECC1LQ69YQ0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SPECC1LQ69YQ0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SPECC1LQ69YQ0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SPECC1LQ69YQ0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SPECC1LQ69YQ0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SPECC1LQ69YQ0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SPECC1LQ69YQ0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SPECC1LQ69YQ0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SPECC1LQ69YQ0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SPECC1LQ69YQ0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SPECC1LQ69YQ0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SPECC1LQ69YQ0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SPECC1LQ69YQ0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPECC1LQ69YQ0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SPECC1LQ69YQ0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SPECC1LQ69YQ0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SPECC1LQ69YQ0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SPECC1LQ69YQ0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SPECC1LQ69YQ0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SPECC1LQ69YQ0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SPECC1LQ69YQ0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SPECC1LQ69YQ0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SPECC1LQ69YQ0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SPECC1LQ69YQ0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SPECC1LQ69YQ0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SPECC1LQ69YQ0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SPECC1LQ69YQ0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SPECC1LQ69YQ0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SPECC1LQ69YQ0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPECC1LQ69YQ0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SPECC1LQ69YQ0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SPECC1LQ69YQ0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SPECC1LQ69YQ0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SPECC1LQ69YQ0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SPECC1LQ69YQ0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SPECC1LQ69YQ0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SPECC1LQ69YQ0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SPECC1LQ69YQ0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SPECC1LQ69YQ0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SPECC1LQ69YQ0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SPECC1LQ69YQ0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SPECC1LQ69YQ0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SPECC1LQ69YQ0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SPECC1LQ69YQ0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SPECC1LQ69YQ0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SPECC1LQ69YQ0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SPECC1LQ69YQ0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SPECC1LQ69YQ0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPECC1LQ69YQ0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SPECC1LQ69YQ0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPECC1LQ69YQ0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPECC1LQ69YQ0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SPECC1LQ69YQ0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPECC1LQ69YQ0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SPECC1LQ69YQ0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SPECC1LQ69YQ0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SPECC1LQ69YQ0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SPECC1LQ69YQ0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SPECC1LQ69YQ0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SPECC1LQ69YQ0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SPECC1LQ69YQ0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SPECC1LQ69YQ0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SPECC1LQ69YQ0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SPECC1LQ69YQ0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SPECC1LQ69YQ0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SPECC1LQ69YQ0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SPECC1LQ69YQ0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SPECC1LQ69YQ0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SPECC1LQ69YQ0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
SPECC1LQ69YQ0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SPECC1LQ69YQ0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SPECC1LQ69YQ0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
SPECC1LQ69YQ0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SPECC1LQ69YQ0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SPECC1LQ69YQ0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SPECC1LQ69YQ0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SPECC1LQ69YQ0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SPECC1LQ69YQ0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SPECC1LQ69YQ0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SPECC1LQ69YQ0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SPECC1LQ69YQ0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SPECC1LQ69YQ0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms