Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM236Q5W0B7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM236Q5W0B7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM236Q5W0B7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM236Q5W0B7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM236Q5W0B7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM236Q5W0B7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM236Q5W0B7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM236Q5W0B7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM236Q5W0B7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM236Q5W0B7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM236Q5W0B7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM236Q5W0B7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM236Q5W0B7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM236Q5W0B7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM236Q5W0B7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM236Q5W0B7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM236Q5W0B7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM236Q5W0B7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM236Q5W0B7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms