Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXI9

LIPN, Lipase member N, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPNQ5VXI9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIPNQ5VXI9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIPNQ5VXI9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LIPNQ5VXI9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPNQ5VXI9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPNQ5VXI9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPNQ5VXI9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIPNQ5VXI9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIPNQ5VXI9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms