Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC38Q5VT99 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC38Q5VT99 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC38Q5VT99 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC38Q5VT99 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC38Q5VT99 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC38Q5VT99 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC38Q5VT99 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC38Q5VT99 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC38Q5VT99 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC38Q5VT99 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC38Q5VT99 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC38Q5VT99 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC38Q5VT99 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC38Q5VT99 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC38Q5VT99 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms