Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ70

SPDYA, Speedy protein A, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYAQ5MJ70 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYAQ5MJ70 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPDYAQ5MJ70 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SPDYAQ5MJ70 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPDYAQ5MJ70 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms