Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDKL4Q5MAI5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL4Q5MAI5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKL4Q5MAI5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL4Q5MAI5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL4Q5MAI5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms