Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCID2Q5JVF3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCID2Q5JVF3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCID2Q5JVF3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PCID2Q5JVF3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCID2Q5JVF3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms