Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRTAP27-1Q3LI81 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP27-1Q3LI81 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms