Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRTAP27-1Q3LI81 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRTAP27-1Q3LI81 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KRTAP27-1Q3LI81 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRTAP27-1Q3LI81 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRTAP27-1Q3LI81 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRTAP27-1Q3LI81 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRTAP27-1Q3LI81 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRTAP27-1Q3LI81 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRTAP27-1Q3LI81 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRTAP27-1Q3LI81 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRTAP27-1Q3LI81 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRTAP27-1Q3LI81 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRTAP27-1Q3LI81 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRTAP27-1Q3LI81 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRTAP27-1Q3LI81 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRTAP27-1Q3LI81 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRTAP27-1Q3LI81 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRTAP27-1Q3LI81 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRTAP27-1Q3LI81 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRTAP27-1Q3LI81 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRTAP27-1Q3LI81 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRTAP27-1Q3LI81 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRTAP27-1Q3LI81 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRTAP27-1Q3LI81 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRTAP27-1Q3LI81 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRTAP27-1Q3LI81 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KRTAP27-1Q3LI81 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRTAP27-1Q3LI81 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRTAP27-1Q3LI81 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRTAP27-1Q3LI81 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRTAP27-1Q3LI81 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRTAP27-1Q3LI81 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRTAP27-1Q3LI81 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRTAP27-1Q3LI81 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRTAP27-1Q3LI81 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRTAP27-1Q3LI81 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRTAP27-1Q3LI81 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRTAP27-1Q3LI81 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRTAP27-1Q3LI81 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRTAP27-1Q3LI81 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRTAP27-1Q3LI81 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRTAP27-1Q3LI81 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRTAP27-1Q3LI81 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRTAP27-1Q3LI81 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRTAP27-1Q3LI81 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRTAP27-1Q3LI81 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRTAP27-1Q3LI81 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRTAP27-1Q3LI81 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRTAP27-1Q3LI81 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRTAP27-1Q3LI81 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRTAP27-1Q3LI81 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRTAP27-1Q3LI81 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRTAP27-1Q3LI81 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRTAP27-1Q3LI81 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRTAP27-1Q3LI81 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRTAP27-1Q3LI81 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRTAP27-1Q3LI81 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRTAP27-1Q3LI81 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRTAP27-1Q3LI81 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRTAP27-1Q3LI81 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRTAP27-1Q3LI81 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRTAP27-1Q3LI81 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRTAP27-1Q3LI81 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRTAP27-1Q3LI81 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRTAP27-1Q3LI81 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRTAP27-1Q3LI81 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRTAP27-1Q3LI81 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRTAP27-1Q3LI81 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRTAP27-1Q3LI81 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRTAP27-1Q3LI81 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
KRTAP27-1Q3LI81 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRTAP27-1Q3LI81 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRTAP27-1Q3LI81 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRTAP27-1Q3LI81 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRTAP27-1Q3LI81 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRTAP27-1Q3LI81 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRTAP27-1Q3LI81 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRTAP27-1Q3LI81 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRTAP27-1Q3LI81 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRTAP27-1Q3LI81 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRTAP27-1Q3LI81 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRTAP27-1Q3LI81 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRTAP27-1Q3LI81 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRTAP27-1Q3LI81 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRTAP27-1Q3LI81 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRTAP27-1Q3LI81 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRTAP27-1Q3LI81 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRTAP27-1Q3LI81 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRTAP27-1Q3LI81 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRTAP27-1Q3LI81 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRTAP27-1Q3LI81 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRTAP27-1Q3LI81 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRTAP27-1Q3LI81 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRTAP27-1Q3LI81 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRTAP27-1Q3LI81 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms