Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSR1Q2NL82 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TSR1Q2NL82 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSR1Q2NL82 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSR1Q2NL82 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSR1Q2NL82 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSR1Q2NL82 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSR1Q2NL82 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSR1Q2NL82 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSR1Q2NL82 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSR1Q2NL82 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSR1Q2NL82 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSR1Q2NL82 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSR1Q2NL82 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSR1Q2NL82 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSR1Q2NL82 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSR1Q2NL82 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSR1Q2NL82 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSR1Q2NL82 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms