Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
KRT24Q2M2I5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KRT24Q2M2I5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KRT24Q2M2I5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KRT24Q2M2I5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KRT24Q2M2I5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KRT24Q2M2I5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KRT24Q2M2I5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KRT24Q2M2I5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KRT24Q2M2I5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KRT24Q2M2I5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KRT24Q2M2I5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KRT24Q2M2I5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KRT24Q2M2I5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KRT24Q2M2I5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KRT24Q2M2I5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KRT24Q2M2I5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KRT24Q2M2I5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KRT24Q2M2I5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KRT24Q2M2I5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KRT24Q2M2I5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KRT24Q2M2I5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
KRT24Q2M2I5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KRT24Q2M2I5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KRT24Q2M2I5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KRT24Q2M2I5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KRT24Q2M2I5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KRT24Q2M2I5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KRT24Q2M2I5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KRT24Q2M2I5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
KRT24Q2M2I5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KRT24Q2M2I5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
KRT24Q2M2I5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KRT24Q2M2I5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KRT24Q2M2I5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KRT24Q2M2I5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KRT24Q2M2I5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KRT24Q2M2I5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
KRT24Q2M2I5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KRT24Q2M2I5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KRT24Q2M2I5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms