Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ODF4Q2M2E3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF4Q2M2E3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms