Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LY6EQ16553 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LY6EQ16553 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LY6EQ16553 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LY6EQ16553 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LY6EQ16553 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LY6EQ16553 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LY6EQ16553 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LY6EQ16553 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LY6EQ16553 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LY6EQ16553 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LY6EQ16553 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LY6EQ16553 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LY6EQ16553 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LY6EQ16553 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LY6EQ16553 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LY6EQ16553 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LY6EQ16553 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LY6EQ16553 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LY6EQ16553 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LY6EQ16553 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LY6EQ16553 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LY6EQ16553 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LY6EQ16553 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LY6EQ16553 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LY6EQ16553 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LY6EQ16553 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LY6EQ16553 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LY6EQ16553 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LY6EQ16553 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LY6EQ16553 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LY6EQ16553 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LY6EQ16553 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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