Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD8Q15843 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD8Q15843 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD8Q15843 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD8Q15843 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD8Q15843 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD8Q15843 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD8Q15843 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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