Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEDD8Q15843 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEDD8Q15843 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEDD8Q15843 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEDD8Q15843 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEDD8Q15843 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEDD8Q15843 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEDD8Q15843 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEDD8Q15843 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEDD8Q15843 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEDD8Q15843 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEDD8Q15843 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEDD8Q15843 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEDD8Q15843 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEDD8Q15843 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEDD8Q15843 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NEDD8Q15843 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEDD8Q15843 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEDD8Q15843 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEDD8Q15843 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEDD8Q15843 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEDD8Q15843 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEDD8Q15843 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEDD8Q15843 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEDD8Q15843 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEDD8Q15843 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEDD8Q15843 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEDD8Q15843 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEDD8Q15843 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD8Q15843 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEDD8Q15843 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEDD8Q15843 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD8Q15843 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEDD8Q15843 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEDD8Q15843 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEDD8Q15843 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEDD8Q15843 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD8Q15843 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD8Q15843 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD8Q15843 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD8Q15843 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEDD8Q15843 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEDD8Q15843 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEDD8Q15843 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEDD8Q15843 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEDD8Q15843 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD8Q15843 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NEDD8Q15843 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEDD8Q15843 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEDD8Q15843 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEDD8Q15843 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEDD8Q15843 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD8Q15843 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEDD8Q15843 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD8Q15843 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD8Q15843 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEDD8Q15843 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD8Q15843 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD8Q15843 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD8Q15843 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD8Q15843 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD8Q15843 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD8Q15843 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD8Q15843 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEDD8Q15843 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD8Q15843 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD8Q15843 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD8Q15843 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD8Q15843 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD8Q15843 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD8Q15843 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD8Q15843 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD8Q15843 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD8Q15843 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD8Q15843 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD8Q15843 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEDD8Q15843 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD8Q15843 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD8Q15843 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD8Q15843 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD8Q15843 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD8Q15843 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD8Q15843 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD8Q15843 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD8Q15843 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD8Q15843 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD8Q15843 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD8Q15843 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD8Q15843 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD8Q15843 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD8Q15843 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD8Q15843 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD8Q15843 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD8Q15843 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD8Q15843 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEDD8Q15843 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEDD8Q15843 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEDD8Q15843 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEDD8Q15843 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEDD8Q15843 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
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