Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNB3Q15768 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFNB3Q15768 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNB3Q15768 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNB3Q15768 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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