Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFNB3Q15768 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EFNB3Q15768 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EFNB3Q15768 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFNB3Q15768 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EFNB3Q15768 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EFNB3Q15768 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EFNB3Q15768 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFNB3Q15768 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EFNB3Q15768 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EFNB3Q15768 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EFNB3Q15768 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EFNB3Q15768 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFNB3Q15768 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFNB3Q15768 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EFNB3Q15768 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EFNB3Q15768 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EFNB3Q15768 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EFNB3Q15768 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFNB3Q15768 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EFNB3Q15768 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EFNB3Q15768 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EFNB3Q15768 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EFNB3Q15768 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EFNB3Q15768 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EFNB3Q15768 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EFNB3Q15768 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EFNB3Q15768 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFNB3Q15768 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFNB3Q15768 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFNB3Q15768 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EFNB3Q15768 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFNB3Q15768 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EFNB3Q15768 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFNB3Q15768 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EFNB3Q15768 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EFNB3Q15768 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EFNB3Q15768 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFNB3Q15768 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EFNB3Q15768 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EFNB3Q15768 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EFNB3Q15768 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFNB3Q15768 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFNB3Q15768 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFNB3Q15768 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFNB3Q15768 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
EFNB3Q15768 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EFNB3Q15768 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EFNB3Q15768 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EFNB3Q15768 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EFNB3Q15768 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EFNB3Q15768 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFNB3Q15768 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EFNB3Q15768 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFNB3Q15768 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFNB3Q15768 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFNB3Q15768 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFNB3Q15768 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFNB3Q15768 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFNB3Q15768 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFNB3Q15768 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFNB3Q15768 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFNB3Q15768 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFNB3Q15768 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFNB3Q15768 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFNB3Q15768 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFNB3Q15768 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFNB3Q15768 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFNB3Q15768 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFNB3Q15768 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFNB3Q15768 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFNB3Q15768 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFNB3Q15768 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFNB3Q15768 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFNB3Q15768 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFNB3Q15768 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFNB3Q15768 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EFNB3Q15768 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFNB3Q15768 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFNB3Q15768 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFNB3Q15768 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFNB3Q15768 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFNB3Q15768 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFNB3Q15768 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFNB3Q15768 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFNB3Q15768 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFNB3Q15768 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFNB3Q15768 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFNB3Q15768 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFNB3Q15768 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFNB3Q15768 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFNB3Q15768 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFNB3Q15768 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFNB3Q15768 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFNB3Q15768 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFNB3Q15768 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFNB3Q15768 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFNB3Q15768 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFNB3Q15768 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFNB3Q15768 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms