Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKD1Q15139 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKD1Q15139 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKD1Q15139 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRKD1Q15139 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKD1Q15139 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKD1Q15139 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKD1Q15139 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKD1Q15139 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKD1Q15139 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKD1Q15139 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKD1Q15139 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKD1Q15139 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKD1Q15139 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKD1Q15139 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKD1Q15139 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKD1Q15139 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
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