Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNAB1Q14722 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNAB1Q14722 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNAB1Q14722 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNAB1Q14722 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNAB1Q14722 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNAB1Q14722 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNAB1Q14722 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNAB1Q14722 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNAB1Q14722 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNAB1Q14722 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNAB1Q14722 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNAB1Q14722 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNAB1Q14722 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNAB1Q14722 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNAB1Q14722 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNAB1Q14722 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNAB1Q14722 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNAB1Q14722 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNAB1Q14722 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNAB1Q14722 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNAB1Q14722 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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